Tühistusnimekirjad on failid, kus on kirjas kõik Eesti ID kaardi sertifikaadid, mille kehtivus on mingil ajahetkel peatatud. Sertifitseerimiskeskuse andmetel võib tühistusnimekirjade uuendamine aega võtta maksimaalselt 12 tundi, seega võib tekkida olukord, kus sertifikaat on juba peatatud, kuid pole jõudnud tühistusnimekirjadesse. Seega on alati kõrgemat turvalisust nõudvate rakenduste puhul soovitav kasutada lisaks külastajalt ka parooli küsimist jne.
Zone virtuaalserveritesse laetakse uusi tühistusnimekirju alla (JUUR-SK ning ESTEID-SK) igal täistunnil.